معاونت پژوهشی دانشکده ماموریت دارد تا زمینه مطلوب را جهت ساماندهی و ارتقای فعالیت های پژوهشی، در راستای برنامه عملیاتی دانشکده و دانشگاه فراهم سازد. اهداف اصلی این معاونت شامل توسعه پژوهش های مبتنی بر حل مشکلات واقعی در حوزه مراقبت سلامت، ایجاد ساز و کار مناسب برای ترجمان دانش از پروژه های تحقیقاتی و پایان نامه های دانشجویی، ارتقای رعایت استانداردهای اخلاق در پژوهش و مدیریت هزینه ها در این مسیر می باشد. برنامه های کلیدی در این راستا شامل رفع نیازهای آموزش در پژوهش توسط برگزاری کارگاه ها و همایش های مناسب، ارتقای کیفی مقالات، افزایش مطالعات توسعه ای و ارتباط با صنعت، اولویت دادن به پژوهش های کیفی با رویکرد اقدام پژوهی، جذب بودجه و افزایش پروژه های مشترک در سطوح ملی و بین المللی می باشد.